动态

• 2013/9/02 基本指南2 翻译完成并上传
• 2013/7/20 德国柏林 HiTSeq 2013 介绍PALMapper。幻灯片下载
• 2013/7/09 PALMapper 0.5版本发布

下载

最新版本：0.5版本下载

若需要其他以往版本请在此获取源代码

云服务

我们搭建了Galaxy服务器以提供PALMapper云服务。请前往https://galaxy.cbio.mskcc.org使用。同时本实验室其他程序也可以在此使用。

依赖

硬件

装有Linux/UNIX 或者 Mac OS X操作系统的计算机

软件

QPALMA

• SWIG
• Python，2.5或者以上版本
• C编译器，如GNU C编译器
• Numpy，Python科学计算包
• PALMapper

训练QPALMA

请使用以下其中一种优化工具包来训练QPALMA

• CVXOPT，免费软件
• MOSEK，商业软件同时提供科研用途的免费版本

PALMapper

• C++编译器
• 诸如wget、make等标准工具
• SAMtools用于处理SAM格式文件

评估工具

• Python，2.5或者以上版本
• Numpy，Python科学计算包
• Gnuplot，4.0或者以上版本
• Biopython

安装

详细文档请参考补充指南1